本发明涉及一种利用酯交换法制备亚磷酸三胆碱酯类季铵盐粘土稳定剂及制备方法。制备方法包括：以亚磷酸三苯酯和胆碱盐类化合物为原料，在碱催化剂和吡啶/二甲亚砜混合溶剂体系中，于70～120℃下发生酯交换反应，反应6～18h，制备亚磷酸三胆碱酯类季铵盐粘土稳定剂粘土稳定剂。本发明方法制备的亚磷酸三胆碱酯类季铵盐粘土稳定剂是对胆碱盐类化合物的结构进行设计，将胆碱盐类化合物中的羟基转化为酯基，以提高其结构稳定性及带电量。所制备的亚磷酸三胆碱酯类季铵盐粘土稳定剂可作为粘土稳定剂、防膨胀剂等，在油藏注水开采作业中，通过抑制储层中粘土矿物颗粒的水化膨胀和分散运移，使油气储层的渗透率尽可能的免受损害。